مطالعات متعدد ارتباط بین سلامت روده و سیستم ایمنی، خلق و خو، سلامت روان، بیماریهای خود ایمنی، اختلالات غدد درون ریز، بیماریهای پوستی و سرطان را نشان دادهاند.